Les meilleurs logiciels de facturation en 2025
Imène Lechkhab
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La facturation est un pilier incontournable de la gestion financière des entreprises. Avec l’obligation de la facturation électronique, qui s’étend progressivement à toutes les entreprises en France, il est crucial de disposer d’outils adaptés pour assurer sa conformité et optimiser ses processus administratifs.
Les logiciels de facturation, en particulier ceux proposés en mode SaaS (Software as a Service), répondent à ces besoins. En tant que solutions en ligne accessibles depuis n’importe quel appareil, ils permettent de gérer devis, factures et paiements en toute simplicité. Mais leur utilité va bien au-delà de la création de documents comptables : ils automatisent des tâches chronophages, réduisent les risques d’erreurs et centralisent les données pour un suivi en temps réel.
En 2025, le marché des logiciels de facturation regorge d’options variées adaptées à tous les profils : freelances, TPE, PME, ou encore grands groupes. Cet article vous guide pour choisir la solution idéale en fonction de vos besoins, en passant en revue les meilleurs outils disponibles et leurs caractéristiques principales.
L’objectif ? Vous aider à trouver le logiciel qui simplifie votre gestion financière tout en assurant votre conformité aux nouvelles normes, telles que le format Factur-X, désormais indispensable pour les échanges électroniques avec les grandes entreprises et les administrations.
Quels sont les avantages d’un logiciel de facturation ?
Un logiciel de facturation n’est pas seulement un outil pratique : il constitue un véritable levier d’efficacité et de conformité pour les entreprises, quelle que soit leur taille. Voici les principaux avantages :
1. Centralisation des données clients
Un logiciel de facturation permet de regrouper toutes les informations sur vos clients en un seul endroit : coordonnées, historique des factures, devis acceptés, paiements en attente. Cette centralisation simplifie la gestion quotidienne et permet un suivi précis des interactions avec vos clients.
2. Respect des règles de facturation et réduction des erreurs
Les logiciels de facturation sont conçus pour respecter les réglementations en vigueur, notamment l’inclusion des mentions obligatoires et la numérotation unique des factures. En automatisant ces tâches, ils réduisent les risques d’erreurs, qui peuvent coûter cher en cas de contrôle fiscal.
3. Suivi et analyse de votre chiffre d’affaires
Grâce à des tableaux de bord et des rapports générés automatiquement, vous pouvez suivre l’évolution de votre chiffre d’affaires, repérer les périodes creuses et les opportunités de croissance. Un atout précieux pour piloter votre activité avec plus de précision.
4. Un gain de temps significatif
La création automatisée de devis, la transformation en factures en un clic et la gestion des paiements en ligne permettent de consacrer moins de temps à l’administratif et davantage à votre cœur de métier.
Bon à savoir :
Cependant, il est à noter que certains logiciels de facturation s’adressent en principe à des professionnels de la gestion financière. Ainsi, la prise en main peut nécessiter un temps d’adaptation.
Plus les fonctionnalités sont avancées — comme la personnalisation de la facture, la comptabilité analytique ou la synchronisation bancaire — plus le coût du logiciel est important.
Le meilleur des choix, serait d’utiliser un logiciel de gestion financière tout-en-un, qui prend en charge la facturation.
Vous pouvez consulter notre comparatif des meilleurs logiciels de gestion de trésorerie : https://www.qotid.com/blog/les-6-meilleurs-logiciels-de-tresorerie
Notre sélection des meilleurs logiciels de facturation
1. Qotid
Avantages :
Adapté aux TPE-PME et groupes multi-sites : Qotid est conçu pour répondre aux besoins des petites et moyennes entreprises, ainsi que des groupes disposant de plusieurs sites, offrant une gestion centralisée de la facturation.
Nombre illimité d’utilisateurs : Le logiciel permet un accès à un nombre illimité d'utilisateurs, facilitant la collaboration au sein de l'entreprise.
Interface intuitive : Qotid propose une interface conviviale, rendant la prise en main facile pour les utilisateurs.
Gestion complète de la facturation : Le logiciel offre des fonctionnalités complètes pour la création, la gestion et le suivi des factures, contribuant à une gestion efficace de la trésorerie.
Permet une vision instantanée des encaissements futurs : Le logiciel propose une fonctionnalité de gestion et suivi de la trésorerie. Chaque devis et facture est connecté à votre tableau de trésorerie et permet d’avoir une vision claire des entrées de cash à venir de votre entreprise et de comparer cela avec vos objectifs.
Inconvénients :
Tarification basée sur le nombre de sociétés et le chiffre d’affaires : Le coût de Qotid évolue en fonction du nombre d’établissements que vous souhaitez intégrer et le tarif ne sera pas le même selon le chiffre d’affaires annuel généré. Pour en savoir plus, demandez un devis.
2. Axonaut
Avantages :
Création et gestion des devis et factures : Axonaut permet de créer des devis et des factures personnalisés, avec la possibilité de les transformer en un clic.
Relances automatiques : Le logiciel offre des fonctionnalités de relance automatique pour les factures impayées, aidant à améliorer le recouvrement des créances.
Intégration bancaire : Axonaut se connecte à vos comptes bancaires pour faciliter le rapprochement des paiements et le suivi de la trésorerie.
CRM intégré : La gestion de la relation client est intégrée, permettant un suivi complet des interactions avec les clients.
Inconvénients :
Absence de génération d’écritures comptables : Axonaut ne génère pas automatiquement les écritures comptables, ce qui peut nécessiter l'utilisation d'un logiciel comptable complémentaire pour assurer une comptabilité complète.
Pas de visibilité sur les entrées de cash à venir dans votre trésorerie.
3. Sellsy
Avantages :
Création de documents variés : Sellsy permet de gérer la facturation avec des bons de commande, des bons de livraison et des factures proforma, offrant une flexibilité dans la gestion des documents commerciaux.
Transformation des devis en factures : En un clic, les devis peuvent être convertis en factures, simplifiant le processus de facturation.
Relances automatiques : Le logiciel permet de paramétrer des plans de relance par e-mail pour les factures et devis, aidant à gérer efficacement les retards de paiement.
Pré-comptabilité : Sellsy offre des fonctionnalités de rapprochement bancaire, de journaux comptables, de plan comptable et d'export FEC pour l'expert-comptable, facilitant la gestion pré-comptable.
Inconvénients :
Absence de comptabilité analytique : Sellsy ne propose pas de fonctionnalités de comptabilité analytique, ce qui peut être une limitation pour les entreprises nécessitant une analyse détaillée de leurs coûts et profits par activité ou projet.
Gestion des abonnements : Sellsy ne permet pas de générer des abonnements sans date de fin ce qui oblige à les renouveler régulièrement.
Pas de possibilité de suivre les prochains flux entrants dans votre trésorerie.
4. Evoliz
Avantages :
Pilotage de la facturation : Evoliz permet la création de devis et de factures, avec un suivi en temps réel des paiements et des relances automatiques pour les factures impayées.
Outils de gestion et de comptabilité : Le logiciel propose des fonctionnalités pour la gestion des relations clients, des fournisseurs et des stocks, ainsi que des outils de comptabilité, offrant une solution complète pour les petites entreprises.
Paiement en ligne : Evoliz permet aux clients de payer les factures en ligne, facilitant le processus de paiement et améliorant la trésorerie.
Inconvénients :
Interface moins intuitive pour les nouveaux utilisateurs : Certains utilisateurs rapportent que la prise en main initiale peut être moins intuitive, nécessitant une période d'adaptation pour maîtriser toutes les fonctionnalités.
Aucune visibilité des encaissements futurs qui s’aligneraient avec vos objectifs.
5. Zervant
Avantages :
Création de devis et factures illimités : Zervant permet de créer un nombre illimité de devis et de factures, avec une interface simple et intuitive, facilitant la facturation pour les petites entreprises.
Envoi de factures électroniques : Le logiciel permet l'envoi de factures électroniques aux entités publiques via l'intégration avec Chorus Pro, assurant la conformité avec les obligations légales.
Services de paiement en ligne et d’affacturage : Zervant offre des services intégrés pour le paiement en ligne et l'affacturage, aidant à améliorer la gestion de la trésorerie.
Inconvénients :
Fonctionnalités limitées pour les entreprises avec des besoins avancés : Zervant est principalement conçu pour les auto-entrepreneurs et peut manquer de fonctionnalités avancées nécessaires aux entreprises de plus grande taille ou avec des besoins spécifiques.
Il n’offre pas une vision claire sur vos prochains encaissements.
6. Facture.net
Avantages :
Solution gratuite : Facture.net est une solution entièrement gratuite, idéale pour les freelances et les petites entreprises ayant des besoins de facturation de base.
Prise en main rapide : Le logiciel offre une interface simple, permettant une création rapide de factures, devis et avoirs, sans courbe d'apprentissage importante.
Inconvénients :
Personnalisation limitée : Facture.net offre peu d'options de personnalisation pour les documents, ce qui peut être un inconvénient pour les entreprises souhaitant adapter les factures à leur image de marque.
Absence de service client : Le logiciel ne propose pas de support client dédié, cependant il existe une FAQ sur leur site.
Pas de vue d’ensemble sur le cash en attente, généré par les factures de vente.
7. Tiime
Avantages :
Une solution à prix compétitif : Tiime propose plusieurs offres pour leur module de facturation. Une offre gratuite, mais aux fonctionnalités très limitées, une offre à 15 euros. L’offre premium est à 30 euros.
Outil intuitif : les utilisateurs trouvent que l’interface est très intuitive, bien que complexe si l’on n’est pas expert-comptable.
Un tableau de bord pour suivre vos flux financiers, idéal pour piloter votre entreprise au quotidien.
Inconvénients :
L’offre gratuite est très limitée et présente donc peu d’intérêt. Quant à l’offre à 15 euros, la possibilité de payer via API (GoCardless, par exemple) n'est pas possible, il faudra donc passer à la version premium, bien plus onéreuse.
Certains utilisateurs ont relevé une certaine complexité de l’interface, ainsi qu’une lenteur de sa performance.
Comment choisir son logiciel de facturation ?
Le choix d’un logiciel de facturation dépend de plusieurs critères :
Taille de votre entreprise : Un auto-entrepreneur n’aura pas les mêmes besoins qu’un groupe multi-sites.
Fonctionnalités disponibles : Présence d’un tableau de bord, gestion multi-TVA, conformité légale, etc.
Nombre d’utilisateurs et d’entités intégrées : Les solutions varient selon qu’elles ciblent des structures simples ou complexes.
Prix et support client : Méfiez-vous des solutions gratuites ou à bas coût qui peuvent manquer de support ou d’options de personnalisation.
Quelles fonctionnalités sont indispensables ?
Tableau de bord intuitif : Suivez votre facturation et vos indicateurs financiers en temps réel.
Gestion des flux financiers : Catégorisation automatique des paiements et des dépenses.
Catalogue produits et services : Facilite la création rapide de devis et factures.
Personnalisation des documents : Ajout du logo, choix des couleurs et mentions légales.
Conformité légale : Intégration de Factur-X pour répondre aux obligations de facturation électronique.
Connexion bancaire : Synchronisation pour un rapprochement automatique des paiements.
Relance client automatique : Optimise le recouvrement des factures impayées.
FAQ
1. Combien coûte un logiciel de facturation ?
Les prix varient selon les fonctionnalités, la taille de l’entreprise et le nombre d’utilisateurs. Les solutions gratuites comme Facture.net conviennent aux freelances, tandis que des outils comme Qotid offrent des options avancées pour les groupes multi-sites.
2. Comment évaluer la qualité du support client ?
Vérifiez la disponibilité (téléphone, email, chat), les avis en ligne et les guides d’utilisation proposés.
3. Peut-on personnaliser un logiciel de facturation ?
Oui, la plupart des logiciels permettent de personnaliser les factures (logos, mentions légales, multi-TVA) et d’intégrer des modules complémentaires (CRM, BI, comptabilité).
